今天，高通量测序技术已经为科学家们提供了一个强有力的工具，可以研究基因组学，生物化学，胚胎发育，炎症反应和免疫反应等各国表型。为了有效地研究这些变体，学者们必须对序列数据进行可靠的测定。截至目前，有两种主要的高通量测序技术，即扩增子测序（amplicon sequencing）和捕获测序（capture sequencing）。因此，本文将比较扩增子测序和捕获测序，以了解它们之间的差异。
从最基本的定义来看，扩增子测序是一种技术，它使用建库技术获得了大量的DNA分子，以复制特定序列。这些复制的DNA分子和短序列标签单独测序，然后分析其分布特征并对其进行比对，以获得所需的序列。另一方面，捕获测序是一种以芯片或其他方式把特定的DNA分子捕获至在特定层面上的一种技术。 它使用对特定DNA致敏的纳米粒子，目标DNA片段因其特定的序列结构而与纳米粒子结合，使其可以连接到芯片上，这样，就可以定位目标序列的起始位置并进行深入分析。
无论是哪种方法，都可以对特定基因组序列进行有效的检测和识别。然而，它们之间也存在一些明显的差异。主要包括：首先，扩增子测序使用从一个样本中获取已知序列的PCR复制方法，以便使用多个样本进行平行测序，而捕获测序使用捕获纳米粒子技术可以更准确地检测和识别特定基因组序列段。其次，扩增子测序的成本要高得多，而捕获测序却更便宜。后者更加普遍，因此学者们为了实现更快更低成本的结果都会首先选择这种方式。第三，扩增子测序常常用于研究DNA变异，而捕获测序则更适合于DNA结合及基因表达研究。
以上就是扩增子测序和捕获测序最显著的区别。然而，选择哪一种技术完全取决于研究者，取决于要研究的序列本身，本研究的目的以及预期成本。总的来说，了解这两种技术的相对优势以及它们之间的差异是非常重要的，因为这可以让科学家们在选择合适的部署方式时避免大量的错误。
