高通量测序与基因芯片，都是有效的基因表达分析的手段，它们之间的使用情况，取决于什么情况。
首先，当研究者想要检测基因的表达水平时，高通量测序的灵活性优于基因芯片。它能够检测多种方式的表达水平，例如：���体浆、血液、细胞等，而基因芯片则能够检测特定组织中的基因表达水平。因此，如果研究者希望把表达水平检测泛化开来，高通量测序就是一个更好的选择。
其次，在分析上，高通量测序和基因芯片有着很大的差异。基因芯片可以检测几百种特定的基因，而高通量测序则可以检测神经组织中的所有基因。因此，高通量测序更有助于突出基因组中的部分基因，而基因芯片主要用于检测基因表达模式。
最后要总结的是，高通量测序和基因芯片，在表达水平检测及分析有着不同的优势，它们只能根据不同的研究任务来选择合适的技术。总的来说，高通量测序可能更适合用于表达水平检测，而基因芯片则更适合用于表达模式检测。
